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山下 菊治 : 硬組織再生生物学会賞, 硬組織再生生物学会, 2004年10月.
山下 菊治 : 論文賞, 日本結合組織学会, 2006年5月.
山下 菊治, 篠原 千尋, 河野 文昭 : 破骨細胞および骨形態に及ぼす炭酸脱水酵素阻害剤アセタゾラミド(AZ)の効果, 硬組織再生生物学会賞, 硬組織再生生物学会, 2008年8月.
山下 菊治 : 再構築細胞外マトリックスをチタン表層に生体活性層として塗布した機能性材料, 第6回アジア科学セミナー会長賞, 中山医学大学, 2010年11月.
山下 菊治 : 解剖学から見た生命科学研究ー遠赤外線エネルギー照射の正体とその効果ー, 徳島大学歯学部優秀教育賞, 歯学部, 2014年7月.