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著書・論文

著書:

1. 堀川 一樹 :
蛍光タンパク質ⅳ.cAMPプローブ, 生きてるものは全部観る! イメージングの選び方・使い方100+実験医学増刊 36 No.20 pp.158-159,,
株式会社 羊土社, 2018年4月.
2. Kazuki Horikawa :
How Low Can You Go? The Numbers of Cells That Make Up Bodies: Large Numbers and Small Numbers, Minorities and Small Numbers from Molecules to Organisms in Biology-Toward a New Understanding of Biological Phenomena, pp.127-133,,
Springer, Apr. 2018.
3. 堀川 一樹, 太田 裕作, 向井 あすか :
細胞集団シグナル伝達の少数制御,
2017年12月.
4. 堀川 一樹 :
少数性生物学, --- 第17章 少数でつくれるか? 体をつくる細胞数──大きな数と小さい数 ---,
日本評論社, 東京, 2017年3月.

学術論文(審査論文):

1. Yusaku Ohta, Toshiaki Furuta, Takeharu Nagai and Kazuki Horikawa :
Red fluorescent cAMP indicator with increased affinity and expanded dynamic range.,
Scientific Reports, Vol.8, No.1, 1866, 2018.
(徳島大学機関リポジトリ: 112438,   DOI: 10.1038/s41598-018-20251-1,   PubMed: 29382930)
2. Ayuko Sakane, Shin Yoshizawa, Masaomi Nishimura, Yuko Tsuchiya, Natsuki Matsushita, Kazuhisa Miyake, Kazuki Horikawa, Issei Imoto, Chiharu Mizuguchi, Hiroyuki Saito, Takato Ueno, Sachi Matsushita, Hisashi Haga, Shinji Deguchi, Kenji Mizuguchi, Hideo Yokota and Takuya Sasaki :
Conformational plasticity of JRAB/MICAL-L2 provides "law and order" in collective cell migration.,
Molecular Biology of the Cell, Vol.27, No.20, 3095-3108, 2016.
(DOI: 10.1091/mbc.E16-05-0332,   PubMed: 27582384)
3. Yusaku Ohta, Takanori Kamagata, Asuka Mukai, Shinji Takada, Takeharu Nagai and Kazuki Horikawa :
Nontrivial Effect of the Color-Exchange of a Donor/Acceptor Pair in the Engineering of Förster Resonance Energy Transfer (FRET)-Based Indicators.,
ACS Chemical Biology, Vol.11, No.7, 1816-1822, 2016.
(DOI: 10.1021/acschembio.6b00221,   PubMed: 27232891,   Elsevier: Scopus)
4. Asuka Mukai, Aya Ichiraku and Kazuki Horikawa :
Reliable handling of highly A/T-rich genomic DNA for efficient generation of knockin strains of Dictyostelium discoideum.,
BMC Biotechnology, Vol.16, 37, 2016.
(徳島大学機関リポジトリ: 114375,   DOI: 10.1186/s12896-016-0267-8,   PubMed: 27075750)
5. James Derek Hanson, Shingen Nakamura, Ryota Amachi, Masahiro Hiasa, Asuka Oda, Daisuke Tsuji, Kohji Itoh, Takeshi Harada, Kazuki Horikawa, Jumpei Teramachi, Hirokazu Miki, Toshio Matsumoto and Masahiro Abe :
Effective impairment of myeloma cells and their progenitors by blockade of monocarboxylate transportation.,
Oncotarget, Vol.6, No.32, 33568-33586, 2015.
(徳島大学機関リポジトリ: 109501,   DOI: 10.18632/oncotarget.5598,   PubMed: 26384349,   Elsevier: Scopus)
6. Michihiro Nakamura, Koichiro Hayashi, Nakano Mutsuki, Kanadani Takafumi, Miyamoto Kazue, Toshinari Kori and Kazuki Horikawa :
Identification of Polyethylene Glycol-Resistant Macrophages on Stealth Imaging In Vitro Using Fluorescent Organosilica Nanoparticles,
ACS Nano, Vol.9, No.2, 1058-1071, 2015.
(DOI: 10.1021/nn502319r,   PubMed: 25629765,   Elsevier: Scopus)
7. Kazuki Horikawa :
Recent progress in the development of genetically encoded Ca2+ indicators.,
The Journal of Medical Investigation : JMI, Vol.62, No.1-2, 24-28, 2015.
(徳島大学機関リポジトリ: 111241,   DOI: 10.2152/jmi.62.24,   PubMed: 25817279,   Elsevier: Scopus)
8. Takeharu Nagai, Kazuki Horikawa, Kenta Saito and Tomoki Matsuda :
Genetically encoded Ca(2+) indicators; expanded affinity range, color hue and compatibility with optogenetics.,
Frontiers in Molecular Neuroscience, Vol.7, 90, 2014.
(DOI: 10.3389/fnmol.2014.00090,   PubMed: 25505381)
9. Kazunori Kanemaru, Hiroshi Sekiya, Ming Xu, Kaname Satoh, Nami Kitajima, Keitaro Yoshida, Yohei Okubo, Takuya Sasaki, Satoru Moritoh, Hidetoshi Hasuwa, Masaru Mimura, Kazuki Horikawa, Ko Matsui, Takeharu Nagai, Masamitsu Iino and Kenji F. Tanaka :
In vivo visualization of subtle, transient, and local activity of astrocytes using an ultrasensitive Ca(2+) indicator.,
Cell Reports, Vol.8, No.1, 311-318, 2014.
(DOI: 10.1016/j.celrep.2014.05.056,   PubMed: 24981861)
10. 堀川 一樹, 永井 健治 :
Ca2+イメージングで解き明かすCa2+動態の時空間統御機構,
Clinical Calcium, Vol.23, No.4, 69-75, 2013年.
11. 堀川 一樹, Takeharu Nagai :
[Spatiotemporal regulation of Ca(2 +) dynamics in live cells revealed by Ca(2 +) imaging].,
Clinical Calcium, Vol.23, No.4, 527-533, 2013年.
(PubMed: 23545742)
12. Tomoki Matsuda, Kazuki Horikawa, Kenta Saito and Takeharu Nagai :
Highlighted Ca2+ imaging with a genetically encoded 'caged' indicator.,
Scientific Reports, Vol.3, 1398, 2013.
(DOI: 10.1038/srep01398,   PubMed: 23474844)
13. Kohei Nishimura, Masamichi Ishiai, Kazuki Horikawa, Tatsuo Fukagawa, Minoru Takata, Haruhiko Takisawa and T Masato Kanemaki :
Mcm8 and Mcm9 form a complex that functions in homologous recombination repair induced by DNA interstrand crosslinks.,
Molecular Cell, Vol.47, No.4, 511-522, 2012.
(DOI: 10.1016/j.molcel.2012.05.047,   PubMed: 22771115)
14. Kenta Saito, Y-F Chang, Kazuki Horikawa, Noriyuki Hatsugai, Yuriko Higuchi, Mitsuru Hashida, Yu Yoshida, Tomoki Matsuda, Yoshiyuki Arai and Takeharu Nagai :
Luminescent proteins for high-speed single-cell and whole-body imaging.,
Nature Communications, Vol.3, 1262, 2012.
(DOI: 10.1038/ncomms2248,   PubMed: 23232392)
15. Yoshiyuki Yamada, Takayuki Michikawa, Mitsuhiro Hashimoto, Kazuki Horikawa, Takeharu Nagai, Atsushi Miyawaki, Michael Häusser and Katsuhiko Mikoshiba :
Quantitative comparison of genetically encoded Ca indicators in cortical pyramidal cells and cerebellar Purkinje cells.,
Frontiers in Cellular Neuroscience, Vol.5, 2011.
(DOI: 10.3389/fncel.2011.00018,   PubMed: 21994490)
16. Kazuki Horikawa, Yoshiyuki Yamada, Tomoki Matsuda, Kentarou Kobayashi, Mitsuhiro Hashimoto, Toru Matsu-ura, Atsushi Miyawaki, Takayuki Michikawa, Katsuhiko Mikoshiba and Takeharu Nagai :
Spontaneous network activity visualized by ultrasensitive Ca(2+) indicators, yellow Cameleon-Nano.,
Nature Methods, Vol.7, No.9, 729-732, 2010.
(DOI: 10.1038/nmeth.1488,   PubMed: 20693999)
17. Kenta Saito, Noriyuki Hatsugai, Kazuki Horikawa, Kentaro Kobayashi, Toru Matsu-Ura, Katsuhiko Mikoshiba and Takeharu Nagai :
Auto-luminescent genetically-encoded ratiometric indicator for real-time Ca2+ imaging at the single cell level.,
PLoS ONE, Vol.5, No.4, e9935, 2010.
(DOI: 10.1371/journal.pone.0009935,   PubMed: 20376337)
18. Kazuki Horikawa and Takeharu Nagai :
[Ultra-sensitive and large-scale imaging of cellular coupled oscillator systems].,
Tanpakushitsu Kakusan Koso, Vol.54, No.15, 1945-1951, 2009.
(PubMed: 19999158)
19. Chie Satou, Yukiko Kimura, Tsunehiko Kohashi, Kazuki Horikawa, Hiroyuki Takeda, Yoichi Oda and Shin-ichi Higashijima :
Functional role of a specialized class of spinal commissural inhibitory neurons during fast escapes in zebrafish.,
The Journal of Neuroscience, Vol.29, No.21, 6780-6793, 2009.
(DOI: 10.1523/JNEUROSCI.0801-09.2009,   PubMed: 19474306)
20. Wataru Tomosugi, Tomoki Matsuda, Tomomi Tani, Tomomi Nemoto, Ippei Kotera, Kenta Saito, Kazuki Horikawa and Takeharu Nagai :
An ultramarine fluorescent protein with increased photostability and pH insensitivity.,
Nature Methods, Vol.6, No.5, 351-353, 2009.
(DOI: 10.1038/nmeth.1317,   PubMed: 19349978)
21. Masashi Tanimoto, Yukiko Ota, Kazuki Horikawa and Yoichi Oda :
Auditory input to CNS is acquired coincidentally with development of inner ear after formation of functional afferent pathway in zebrafish.,
The Journal of Neuroscience, Vol.29, No.9, 2762-2767, 2009.
(DOI: 10.1523/JNEUROSCI.5530-08.2009,   PubMed: 19261871)
22. Saori Nagayoshi, Eriko Hayashi, Gembu Abe, Naoki Osato, Kazuhide Asakawa, Akihiro Urasaki, Kazuki Horikawa, Kazuho Ikeo, Hiroyuki Takeda and Koichi Kawakami :
Insertional mutagenesis by the Tol2 transposon-mediated enhancer trap approach generated mutations in two developmental genes: tcf7 and synembryn-like.,
Development, Vol.135, No.1, 159-169, 2008.
(DOI: 10.1242/dev.009050,   PubMed: 18065431)
23. Kana Ishimatsu, Kazuki Horikawa and Hiroyuki Takeda :
Coupling cellular oscillators: a mechanism that maintains synchrony against developmental noise in the segmentation clock.,
Developmental Dynamics, Vol.236, No.6, 1416-1421, 2007.
(DOI: 10.1002/dvdy.21139,   PubMed: 17420984)
24. Hiroyuki Takeda and Kazuki Horikawa :
[Basic principle of the segmentation clock: synchronization and robustness to noise].,
Tanpakushitsu Kakusan Koso, Vol.52, No.3, 236-242, 2007.
(PubMed: 17352188)
25. Kazuki Horikawa, Kana Ishimatsu, Eiichi Yoshimoto, Shigeru Kondo and Hiroyuki Takeda :
Noise-resistant and synchronized oscillation of the segmentation clock.,
Nature, Vol.441, No.7094, 719-723, 2006.
(DOI: 10.1038/nature04861,   PubMed: 16760970)

学術論文(紀要・その他):

1. Kakizuka Taishi, Yusuke Hara, Ohta Yusaku, mukai Asuka, Ichiraku Aya, Arai Yoshiyuki, Ichimura Taro, Nagai Takeharu and Kazuki Horikawa :
Cellular logics bringing the symmetry breaking in spiral nucleation revealed by trans-scale imaging,
bioRxiv, 2020.
(DOI: 10.1101/2020.06.29.176891)

学術レター:

1. 堀川 一樹 :
Fluorescent probes for bio-imaging of bone,
The Bone, Vol.28, No.2, 67-72, 2014年.

国際会議:

1. Masaki Morishima, Kazuki Horikawa and Makoto Funaki :
Mechanically Physiological Microenvironment Sensitizes Primary Cardiomyocytes to Glucotoxicity; New In Vitro Diabetic Heart Research Model,
Diabetes, San Diego, Jun. 2017.
2. Naoki Muguruma, Yoshihiko Miyamoto, Shota Fujimoto, Tadahiko Nakagawa, Shinji Kitamura, Tetsuo Kimura, Koichi Okamoto, Hiroshi Miyamoto, Kazuki Horikawa and Tetsuji Takayama :
Endoscopic molecular imaging of colorectal cancer targeting epidermal growth factor receptor.,
APDW2015, Taipei, Dec. 2015.
3. Takashi Uebansou, Takaaki Shimohata, Iba Hitomi, Nishimura Kazuya, Taniguchi Yuichi, Kazuki Horikawa, Mutsumi Nakahashi, Kazuaki Mawatari and Akira Takahashi :
COMBINATION BETWEEN A FEW T3SS INJECTISOME AND A LOT EFFECTOR FOR KILLING HOST CELLS ON VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS,
6th FEMS Microbiology Congress, Jun. 2015.

国内講演発表:

1. 堀川 一樹 :
第42回日本分子生物学会,
2019年12月.
2. Kazuki Horikawa :
ICSB2019,
Oct. 2019.
3. 堀川 一樹 :
第57回日本生物物理学会,
2019年9月.
4. 堀川 一樹 :
日本細胞生物学会,
2019年6月.
5. 堀川 一樹 :
シンギュラリティ生物学キックオフシンポジウム,
2018年9月.
6. 堀川 一樹 :
第56回日本生物物理学会年会での講演,
2018年9月.
7. 堀川 一樹 :
第29回細胞生物学ワークショップ・「FRETの基礎」「多点走査顕微鏡」講義および実習,
2018年8月.
8. 堀川 一樹 :
第29回細胞生物学ワークショップ・「蛍光タンパク質の性質」講義,
2018年8月.
9. 堀川 一樹 :
脳構築における発生時間と場の連携・第3回領域班会議への出席と発表,
2018年7月.
10. Kazuki Horikawa :
Red fluorescent cAMP indicator with increased affinity and expanded dynamic range,
The 18th Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan, Niigata, Japan,, Jun. 2018.
11. 堀川 一樹 :
1分子から個体レベルまでの多階層バイオイメージング,
公開シンポジウム 次世代バイオイメージングの研究の展望, 2017年8月.
12. 堀川 一樹 :
バイオイメージング拠点四国研究会,
2016年11月.
13. 堀川 一樹 :
京都大学生命科学リトリート,
2016年10月.
14. 堀川 一樹 :
in vivo イメージング 研究会,
2016年7月.

その他・研究会:

1. 堀川 一樹 :
シンギュラリティ生物学デザイン思考研究会,
2019年2月.
2. 堀川 一樹 :
第7回さきがけ終了領域研究会,
2018年10月.
3. 堀川 一樹 :
イメージングプラットフォームに関する会議,
2018年8月.
4. 堀川 一樹 :
新学術領域「シンギュラリティ生物学」・第1回領域班会議,
2018年8月.

科学研究費補助金 (KAKEN Grants Database @ NII.ac.jp)

  • 動脈硬化の進展と破綻における新規の慢性炎症惹起機構の解明と治療法の開発 (研究課題/領域番号: 19H03654 )
  • 多細胞システムのパターン形成を駆動するシンギュラリティ細胞の同定と操作 (研究課題/領域番号: 18H05415 )
  • パルス回数を時間情報に変換する機構の解明 (研究課題/領域番号: 17H05770 )
  • 一分子計測・操作による cAMP 発振回路の構築機構の解明 (研究課題/領域番号: 15K14491 )
  • マクロファージの異常な活性化に起因する慢性炎症発症機序の解明 (研究課題/領域番号: 25113716 )
  • in vivoイメージング解析による血管平滑筋の収縮機構の解明 (研究課題/領域番号: 25840050 )
  • 動脈壁と周囲脂肪組織における慢性炎症の可視化と病態解明 (研究課題/領域番号: 25293184 )
  • 多細胞社会の秩序形成を司る細胞個性のマルチスケール定量と操作 (研究課題/領域番号: 23127512 )
  • 分子プローブと光摂動ツールの開発-少数生体分子の可視化・操作技術- (研究課題/領域番号: 23115003 )
  • 少数性生物学ー個と多数の狭間が織りなす生命現象の探求ー (研究課題/領域番号: 23115001 )
  • 多細胞ネットワークの動作揺らぎを検出する階層横断的・多機能イメージング技術の開発 (研究課題/領域番号: 22770182 )
  • エンハンサートラップ法とライブイメージングを軸とした聴覚システム発生機構の研究 (研究課題/領域番号: 18870004 )
  • 少数分子による自己組織化過程の生体機能シグナル可視化による解析 (研究課題/領域番号: 18687014 )
  • 研究者番号(70420247)による検索